Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLFQ13129 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLFQ13129 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLFQ13129 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLFQ13129 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLFQ13129 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLFQ13129 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLFQ13129 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLFQ13129 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RLFQ13129 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RLFQ13129 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLFQ13129 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLFQ13129 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RLFQ13129 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLFQ13129 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLFQ13129 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLFQ13129 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLFQ13129 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLFQ13129 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLFQ13129 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLFQ13129 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLFQ13129 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RLFQ13129 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLFQ13129 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLFQ13129 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLFQ13129 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLFQ13129 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLFQ13129 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLFQ13129 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLFQ13129 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLFQ13129 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLFQ13129 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLFQ13129 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLFQ13129 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLFQ13129 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RLFQ13129 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RLFQ13129 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLFQ13129 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLFQ13129 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLFQ13129 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLFQ13129 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RLFQ13129 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RLFQ13129 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLFQ13129 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLFQ13129 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLFQ13129 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLFQ13129 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLFQ13129 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLFQ13129 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLFQ13129 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLFQ13129 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLFQ13129 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLFQ13129 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLFQ13129 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RLFQ13129 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLFQ13129 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLFQ13129 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLFQ13129 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLFQ13129 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLFQ13129 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLFQ13129 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RLFQ13129 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLFQ13129 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLFQ13129 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLFQ13129 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLFQ13129 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLFQ13129 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLFQ13129 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLFQ13129 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLFQ13129 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLFQ13129 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLFQ13129 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLFQ13129 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLFQ13129 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLFQ13129 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLFQ13129 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLFQ13129 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLFQ13129 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RLFQ13129 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RLFQ13129 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLFQ13129 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLFQ13129 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLFQ13129 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLFQ13129 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLFQ13129 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLFQ13129 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLFQ13129 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RLFQ13129 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLFQ13129 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLFQ13129 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLFQ13129 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLFQ13129 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RLFQ13129 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLFQ13129 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLFQ13129 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLFQ13129 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RLFQ13129 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLFQ13129 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLFQ13129 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLFQ13129 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
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