Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
PRDM2Q13029 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PRDM2Q13029 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PRDM2Q13029 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
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