Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SREBF2Q12772 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
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