Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 YER137W-AYER137W-A 306 nt2.14□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 YNL010WYNL010W 726 nt2.14□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 YOR146WYOR146W 306 nt2.14□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 CDC60YPL160W 3273 nt2.14□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 RUD3YOR216C 1455 nt2.14□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 UTP21YLR409C 2820 nt2.13□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 NUP100YKL068W 2880 nt2.13□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 NOP10YHR072W-A 177 nt2.13□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 RPS17AYML024W 411 nt2.13□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 YBL071CYBL071C 309 nt2.13□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 YPR146CYPR146C 330 nt2.13□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 GCN2YDR283C 4980 nt2.13□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 YEL043WYEL043W 2871 nt2.13□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 SMD1YGR074W 441 nt2.12□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 RTT102YGR275W 474 nt2.12□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 RPS18BYML026C 441 nt2.12□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 YPL238CYPL238C 390 nt2.12□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 VPS35YJL154C 2835 nt2.11□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 KAR3YPR141C 2190 nt2.11□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 FMP16YDR070C 282 nt2.11□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 DAD4YDR320C-A 219 nt2.11□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 YPP1YGR198W 2454 nt2.11□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 MSL5YLR116W 1431 nt2.1□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 GNT1YOR320C 1476 nt2.1□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.1□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 RRP6YOR001W 2202 nt2.1□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 MSS11YMR164C 2277 nt2.1□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 NAB6YML117W 3405 nt2.09□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 SNC1YAL030W 354 nt2.09□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 FCF2YLR051C 654 nt2.09□□□□□ -2.07
LSP1Q12230 SPO22YIL073C 2928 nt2.09□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 LRE1YCL051W 1752 nt2.08□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 YOR121CYOR121C 306 nt2.08□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 DFG16YOR030W 1860 nt2.07□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 QCR7YDR529C 384 nt2.07□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 RTR1YER139C 681 nt2.07□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.07□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 YNL058CYNL058C 951 nt2.07□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 BUD2YKL092C 3315 nt2.07□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 IRA1YBR140C 9279 nt2.06□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 UBR2YLR024C 5619 nt2.06□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 SIR4YDR227W 4077 nt2.06□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 WIP1YDR374W-A 270 nt2.06□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 YHR210CYHR210C 1026 nt2.06□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 VTI1YMR197C 654 nt2.06□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt2.06□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 YBL108WYBL108W 306 nt2.06□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 SNC2YOR327C 348 nt2.06□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 YPR197CYPR197C 564 nt2.06□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 YJR098CYJR098C 1971 nt2.06□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt2.05□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 IRC20YLR247C 4671 nt2.05□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 CDC50YCR094W 1176 nt2.04□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 YAP6YDR259C 1152 nt2.04□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 YGL024WYGL024W 336 nt2.04□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 RPS20YHL015W 366 nt2.04□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 YML009C-AYML009C-A 327 nt2.04□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 MEC1YBR136W 7107 nt2.04□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 VMR1YHL035C 4779 nt2.03□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 CFT1YDR301W 4074 nt2.03□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 STB4YMR019W 2850 nt2.03□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 IST2YBR086C 2841 nt2.03□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 LYS9YNR050C 1341 nt2.03□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 YGR035CYGR035C 351 nt2.03□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt2.03□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 TMA7YLR262C-A 195 nt2.03□□□□□ -2.08
LSP1Q12230 SGD1YLR336C 2700 nt2.03□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 BRR2YER172C 6492 nt2.02□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 MSL1YIR009W 336 nt2.02□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 YGL069CYGL069C 465 nt2.01□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 CHC1YGL206C 4962 nt2.01□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 CDC53YDL132W 2448 nt2.01□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 YDL011CYDL011C 324 nt2□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt2□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 RPL26AYLR344W 384 nt2□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 RPL9BYNL067W 576 nt2□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt2□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 YPR099CYPR099C 357 nt2□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 YGL239CYGL239C 315 nt1.99□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 HCH1YNL281W 462 nt1.99□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt1.99□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 YBR224WYBR224W 516 nt1.99□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 ATG9YDL149W 2994 nt1.99□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 CDC27YBL084C 2277 nt1.98□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 PDR8YLR266C 2106 nt1.98□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 CGI121YML036W 546 nt1.98□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 ISF1YMR081C 1017 nt1.98□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 YPL182CYPL182C 384 nt1.98□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 YPL225WYPL225W 441 nt1.98□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 VPH1YOR270C 2523 nt1.98□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 NOT5YPR072W 1683 nt1.98□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 SOK2YMR016C 2358 nt1.98□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 YJR003CYJR003C 1560 nt1.98□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 PCF11YDR228C 1881 nt1.97□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 RBK1YCR036W 1002 nt1.97□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 HSK3YKL138C-A 210 nt1.97□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 YML003WYML003W 873 nt1.97□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.97□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 LHS1YKL073W 2646 nt1.97□□□□□ -2.09
LSP1Q12230 HOP2YGL033W 657 nt1.96□□□□□ -2.1
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