Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4DQ08499 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms