Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RAD51Q06609 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms