Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms