Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms