Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF85Q03923 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF85Q03923 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF85Q03923 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF85Q03923 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms