Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms