Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POU5F1Q01860 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms