Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MC1RQ01726 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms