Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG7P83436 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG7P83436 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG7P83436 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG7P83436 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG7P83436 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG7P83436 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG7P83436 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG7P83436 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG7P83436 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG7P83436 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG7P83436 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG7P83436 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG7P83436 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG7P83436 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG7P83436 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COG7P83436 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG7P83436 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG7P83436 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG7P83436 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG7P83436 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG7P83436 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG7P83436 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG7P83436 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG7P83436 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG7P83436 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG7P83436 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG7P83436 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG7P83436 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG7P83436 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG7P83436 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG7P83436 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG7P83436 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG7P83436 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
COG7P83436 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
COG7P83436 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG7P83436 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG7P83436 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG7P83436 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG7P83436 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG7P83436 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG7P83436 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG7P83436 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG7P83436 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG7P83436 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG7P83436 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG7P83436 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG7P83436 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
COG7P83436 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG7P83436 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG7P83436 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG7P83436 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG7P83436 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG7P83436 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
COG7P83436 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG7P83436 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG7P83436 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG7P83436 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG7P83436 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG7P83436 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG7P83436 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG7P83436 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG7P83436 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG7P83436 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG7P83436 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG7P83436 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG7P83436 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG7P83436 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
COG7P83436 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
COG7P83436 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG7P83436 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG7P83436 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG7P83436 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG7P83436 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG7P83436 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG7P83436 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG7P83436 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG7P83436 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG7P83436 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
COG7P83436 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG7P83436 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG7P83436 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
COG7P83436 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
COG7P83436 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG7P83436 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG7P83436 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG7P83436 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG7P83436 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG7P83436 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG7P83436 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG7P83436 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG7P83436 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG7P83436 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG7P83436 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG7P83436 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG7P83436 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG7P83436 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG7P83436 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG7P83436 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
COG7P83436 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms