Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL20P78556 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL20P78556 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL20P78556 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL20P78556 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL20P78556 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL20P78556 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL20P78556 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL20P78556 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL20P78556 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL20P78556 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL20P78556 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL20P78556 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL20P78556 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL20P78556 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL20P78556 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL20P78556 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL20P78556 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL20P78556 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL20P78556 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL20P78556 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL20P78556 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL20P78556 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL20P78556 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL20P78556 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL20P78556 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL20P78556 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL20P78556 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL20P78556 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL20P78556 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL20P78556 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL20P78556 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL20P78556 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL20P78556 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL20P78556 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL20P78556 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL20P78556 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL20P78556 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL20P78556 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL20P78556 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL20P78556 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL20P78556 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL20P78556 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL20P78556 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL20P78556 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL20P78556 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL20P78556 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL20P78556 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL20P78556 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL20P78556 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL20P78556 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL20P78556 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL20P78556 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL20P78556 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL20P78556 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL20P78556 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL20P78556 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL20P78556 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL20P78556 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL20P78556 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL20P78556 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL20P78556 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL20P78556 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL20P78556 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL20P78556 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL20P78556 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL20P78556 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL20P78556 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL20P78556 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL20P78556 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL20P78556 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL20P78556 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL20P78556 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL20P78556 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL20P78556 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL20P78556 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL20P78556 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL20P78556 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL20P78556 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL20P78556 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL20P78556 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL20P78556 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL20P78556 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL20P78556 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL20P78556 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL20P78556 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL20P78556 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL20P78556 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL20P78556 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL20P78556 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL20P78556 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL20P78556 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL20P78556 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL20P78556 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL20P78556 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL20P78556 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL20P78556 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL20P78556 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL20P78556 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL20P78556 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms