Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms