Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL23P62829 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL23P62829 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL23P62829 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL23P62829 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL23P62829 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL23P62829 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL23P62829 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL23P62829 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL23P62829 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL23P62829 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL23P62829 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL23P62829 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL23P62829 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL23P62829 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL23P62829 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL23P62829 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL23P62829 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL23P62829 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL23P62829 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL23P62829 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL23P62829 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL23P62829 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL23P62829 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL23P62829 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL23P62829 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL23P62829 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL23P62829 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL23P62829 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL23P62829 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL23P62829 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL23P62829 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL23P62829 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL23P62829 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL23P62829 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL23P62829 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL23P62829 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL23P62829 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL23P62829 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL23P62829 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL23P62829 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL23P62829 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL23P62829 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL23P62829 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL23P62829 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL23P62829 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL23P62829 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL23P62829 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL23P62829 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL23P62829 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL23P62829 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL23P62829 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL23P62829 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL23P62829 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL23P62829 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL23P62829 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL23P62829 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL23P62829 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms