Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNRPD2P62316 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms