Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VBP1P61758 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VBP1P61758 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VBP1P61758 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VBP1P61758 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VBP1P61758 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VBP1P61758 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VBP1P61758 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VBP1P61758 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VBP1P61758 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VBP1P61758 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VBP1P61758 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VBP1P61758 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VBP1P61758 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VBP1P61758 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VBP1P61758 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VBP1P61758 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VBP1P61758 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VBP1P61758 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VBP1P61758 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VBP1P61758 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VBP1P61758 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VBP1P61758 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VBP1P61758 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VBP1P61758 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
VBP1P61758 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VBP1P61758 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VBP1P61758 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VBP1P61758 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VBP1P61758 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VBP1P61758 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VBP1P61758 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VBP1P61758 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VBP1P61758 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VBP1P61758 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VBP1P61758 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VBP1P61758 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VBP1P61758 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VBP1P61758 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VBP1P61758 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VBP1P61758 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VBP1P61758 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VBP1P61758 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VBP1P61758 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VBP1P61758 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VBP1P61758 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VBP1P61758 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VBP1P61758 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VBP1P61758 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VBP1P61758 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VBP1P61758 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VBP1P61758 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VBP1P61758 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VBP1P61758 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VBP1P61758 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VBP1P61758 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VBP1P61758 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VBP1P61758 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VBP1P61758 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VBP1P61758 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VBP1P61758 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VBP1P61758 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VBP1P61758 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VBP1P61758 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VBP1P61758 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VBP1P61758 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VBP1P61758 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VBP1P61758 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VBP1P61758 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VBP1P61758 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VBP1P61758 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VBP1P61758 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VBP1P61758 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VBP1P61758 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VBP1P61758 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VBP1P61758 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VBP1P61758 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VBP1P61758 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VBP1P61758 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VBP1P61758 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VBP1P61758 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VBP1P61758 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VBP1P61758 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VBP1P61758 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VBP1P61758 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VBP1P61758 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VBP1P61758 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VBP1P61758 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VBP1P61758 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VBP1P61758 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VBP1P61758 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VBP1P61758 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VBP1P61758 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VBP1P61758 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VBP1P61758 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VBP1P61758 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VBP1P61758 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VBP1P61758 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VBP1P61758 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VBP1P61758 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms