Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERV-K104P61576 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HERV-K104P61576 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HERV-K104P61576 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HERV-K104P61576 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HERV-K104P61576 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERV-K104P61576 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms