Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4A1P60842 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EIF4A1P60842 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EIF4A1P60842 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EIF4A1P60842 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EIF4A1P60842 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EIF4A1P60842 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EIF4A1P60842 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EIF4A1P60842 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EIF4A1P60842 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EIF4A1P60842 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms