Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATN1P54259 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATN1P54259 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATN1P54259 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATN1P54259 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATN1P54259 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATN1P54259 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATN1P54259 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATN1P54259 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATN1P54259 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATN1P54259 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATN1P54259 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATN1P54259 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATN1P54259 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATN1P54259 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATN1P54259 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATN1P54259 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATN1P54259 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATN1P54259 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATN1P54259 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATN1P54259 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATN1P54259 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATN1P54259 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATN1P54259 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATN1P54259 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATN1P54259 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATN1P54259 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATN1P54259 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATN1P54259 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATN1P54259 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATN1P54259 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATN1P54259 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATN1P54259 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATN1P54259 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATN1P54259 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATN1P54259 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATN1P54259 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATN1P54259 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATN1P54259 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATN1P54259 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATN1P54259 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATN1P54259 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATN1P54259 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATN1P54259 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATN1P54259 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATN1P54259 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATN1P54259 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATN1P54259 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATN1P54259 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATN1P54259 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATN1P54259 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATN1P54259 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATN1P54259 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATN1P54259 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATN1P54259 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATN1P54259 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATN1P54259 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATN1P54259 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATN1P54259 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATN1P54259 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATN1P54259 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATN1P54259 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATN1P54259 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATN1P54259 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATN1P54259 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATN1P54259 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATN1P54259 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATN1P54259 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATN1P54259 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATN1P54259 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATN1P54259 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATN1P54259 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATN1P54259 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATN1P54259 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATN1P54259 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATN1P54259 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATN1P54259 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATN1P54259 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATN1P54259 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATN1P54259 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATN1P54259 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATN1P54259 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATN1P54259 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATN1P54259 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATN1P54259 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATN1P54259 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATN1P54259 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATN1P54259 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATN1P54259 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATN1P54259 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATN1P54259 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATN1P54259 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATN1P54259 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATN1P54259 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATN1P54259 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATN1P54259 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATN1P54259 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATN1P54259 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATN1P54259 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATN1P54259 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms