Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBP50607 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBP50607 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBP50607 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TUBP50607 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBP50607 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TUBP50607 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBP50607 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBP50607 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBP50607 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBP50607 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBP50607 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBP50607 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBP50607 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBP50607 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBP50607 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBP50607 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBP50607 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBP50607 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBP50607 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBP50607 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBP50607 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBP50607 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBP50607 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBP50607 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBP50607 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBP50607 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBP50607 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBP50607 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBP50607 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBP50607 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TUBP50607 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TUBP50607 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBP50607 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBP50607 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBP50607 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBP50607 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBP50607 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBP50607 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBP50607 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBP50607 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBP50607 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBP50607 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBP50607 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBP50607 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBP50607 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBP50607 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBP50607 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TUBP50607 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBP50607 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBP50607 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBP50607 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBP50607 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBP50607 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBP50607 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBP50607 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBP50607 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TUBP50607 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBP50607 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBP50607 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBP50607 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBP50607 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBP50607 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBP50607 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBP50607 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBP50607 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBP50607 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBP50607 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TUBP50607 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBP50607 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBP50607 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBP50607 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBP50607 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBP50607 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBP50607 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBP50607 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBP50607 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBP50607 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBP50607 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBP50607 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBP50607 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBP50607 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBP50607 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBP50607 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBP50607 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBP50607 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBP50607 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBP50607 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBP50607 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBP50607 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBP50607 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBP50607 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBP50607 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBP50607 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBP50607 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBP50607 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBP50607 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBP50607 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBP50607 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBP50607 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms