Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFBP49765 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms