Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA8P48165 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA8P48165 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA8P48165 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA8P48165 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA8P48165 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA8P48165 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA8P48165 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA8P48165 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA8P48165 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA8P48165 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA8P48165 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA8P48165 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA8P48165 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA8P48165 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA8P48165 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA8P48165 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA8P48165 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA8P48165 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA8P48165 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA8P48165 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA8P48165 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA8P48165 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA8P48165 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA8P48165 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA8P48165 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA8P48165 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA8P48165 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA8P48165 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA8P48165 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA8P48165 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA8P48165 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA8P48165 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA8P48165 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA8P48165 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA8P48165 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA8P48165 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA8P48165 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA8P48165 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJA8P48165 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJA8P48165 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA8P48165 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA8P48165 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA8P48165 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA8P48165 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA8P48165 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA8P48165 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA8P48165 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA8P48165 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA8P48165 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA8P48165 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA8P48165 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA8P48165 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA8P48165 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA8P48165 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA8P48165 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA8P48165 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA8P48165 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA8P48165 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA8P48165 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA8P48165 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA8P48165 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA8P48165 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA8P48165 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA8P48165 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA8P48165 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA8P48165 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA8P48165 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA8P48165 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA8P48165 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA8P48165 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA8P48165 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA8P48165 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA8P48165 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA8P48165 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA8P48165 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA8P48165 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA8P48165 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA8P48165 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA8P48165 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA8P48165 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA8P48165 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA8P48165 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA8P48165 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA8P48165 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA8P48165 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA8P48165 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA8P48165 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA8P48165 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA8P48165 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA8P48165 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA8P48165 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA8P48165 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA8P48165 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA8P48165 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA8P48165 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA8P48165 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA8P48165 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA8P48165 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA8P48165 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms