Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEDD4P46934 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD4P46934 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms