Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP8P40818 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP8P40818 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP8P40818 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP8P40818 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP8P40818 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP8P40818 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP8P40818 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP8P40818 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP8P40818 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP8P40818 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP8P40818 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP8P40818 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP8P40818 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP8P40818 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP8P40818 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP8P40818 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP8P40818 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP8P40818 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP8P40818 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP8P40818 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP8P40818 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP8P40818 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP8P40818 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP8P40818 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP8P40818 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP8P40818 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP8P40818 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP8P40818 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP8P40818 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP8P40818 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP8P40818 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP8P40818 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP8P40818 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP8P40818 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP8P40818 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP8P40818 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP8P40818 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP8P40818 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP8P40818 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP8P40818 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP8P40818 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP8P40818 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP8P40818 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP8P40818 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP8P40818 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP8P40818 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP8P40818 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP8P40818 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP8P40818 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP8P40818 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP8P40818 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP8P40818 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP8P40818 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP8P40818 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP8P40818 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP8P40818 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP8P40818 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP8P40818 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP8P40818 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP8P40818 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP8P40818 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP8P40818 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP8P40818 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP8P40818 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP8P40818 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP8P40818 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP8P40818 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP8P40818 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP8P40818 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP8P40818 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP8P40818 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP8P40818 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP8P40818 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP8P40818 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP8P40818 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP8P40818 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP8P40818 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP8P40818 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP8P40818 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP8P40818 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP8P40818 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP8P40818 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP8P40818 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP8P40818 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP8P40818 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP8P40818 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP8P40818 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP8P40818 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP8P40818 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP8P40818 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP8P40818 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP8P40818 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP8P40818 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP8P40818 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP8P40818 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP8P40818 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP8P40818 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP8P40818 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP8P40818 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms