Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FDFT1P37268 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FDFT1P37268 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms