Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT2P35908 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT2P35908 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KRT2P35908 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT2P35908 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT2P35908 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT2P35908 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT2P35908 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT2P35908 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT2P35908 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT2P35908 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT2P35908 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT2P35908 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT2P35908 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT2P35908 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT2P35908 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT2P35908 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT2P35908 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT2P35908 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT2P35908 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT2P35908 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT2P35908 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT2P35908 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT2P35908 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT2P35908 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT2P35908 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT2P35908 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT2P35908 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT2P35908 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT2P35908 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT2P35908 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT2P35908 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT2P35908 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT2P35908 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT2P35908 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT2P35908 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT2P35908 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT2P35908 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT2P35908 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT2P35908 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT2P35908 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT2P35908 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT2P35908 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT2P35908 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT2P35908 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT2P35908 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT2P35908 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT2P35908 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT2P35908 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT2P35908 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT2P35908 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT2P35908 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT2P35908 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT2P35908 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT2P35908 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT2P35908 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT2P35908 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT2P35908 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT2P35908 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT2P35908 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT2P35908 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT2P35908 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT2P35908 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT2P35908 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT2P35908 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT2P35908 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT2P35908 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT2P35908 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT2P35908 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT2P35908 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT2P35908 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT2P35908 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT2P35908 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT2P35908 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT2P35908 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT2P35908 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT2P35908 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT2P35908 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT2P35908 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT2P35908 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT2P35908 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT2P35908 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT2P35908 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT2P35908 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT2P35908 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT2P35908 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT2P35908 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT2P35908 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT2P35908 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT2P35908 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT2P35908 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT2P35908 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT2P35908 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT2P35908 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT2P35908 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT2P35908 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT2P35908 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT2P35908 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT2P35908 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT2P35908 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms