Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCN4AP35499 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN4AP35499 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN4AP35499 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN4AP35499 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN4AP35499 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN4AP35499 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN4AP35499 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN4AP35499 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN4AP35499 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN4AP35499 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN4AP35499 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN4AP35499 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN4AP35499 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN4AP35499 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN4AP35499 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN4AP35499 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN4AP35499 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN4AP35499 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN4AP35499 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN4AP35499 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN4AP35499 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms