Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNB1P35222 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms