Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TM4SF1P30408 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms