Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMPK1P30085 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms