Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms