Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4BP23588 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms