Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX1P22670 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX1P22670 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX1P22670 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX1P22670 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX1P22670 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX1P22670 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX1P22670 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX1P22670 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX1P22670 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX1P22670 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX1P22670 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX1P22670 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX1P22670 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX1P22670 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX1P22670 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX1P22670 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX1P22670 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX1P22670 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX1P22670 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX1P22670 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX1P22670 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX1P22670 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX1P22670 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX1P22670 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX1P22670 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX1P22670 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX1P22670 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX1P22670 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX1P22670 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX1P22670 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX1P22670 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX1P22670 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX1P22670 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX1P22670 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX1P22670 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX1P22670 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX1P22670 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX1P22670 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX1P22670 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX1P22670 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX1P22670 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX1P22670 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX1P22670 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX1P22670 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX1P22670 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX1P22670 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX1P22670 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX1P22670 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX1P22670 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX1P22670 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX1P22670 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RFX1P22670 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
RFX1P22670 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RFX1P22670 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RFX1P22670 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX1P22670 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX1P22670 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX1P22670 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX1P22670 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX1P22670 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX1P22670 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX1P22670 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX1P22670 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX1P22670 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX1P22670 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX1P22670 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX1P22670 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX1P22670 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX1P22670 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX1P22670 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX1P22670 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX1P22670 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX1P22670 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX1P22670 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX1P22670 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX1P22670 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX1P22670 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX1P22670 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX1P22670 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX1P22670 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX1P22670 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX1P22670 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX1P22670 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX1P22670 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX1P22670 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX1P22670 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX1P22670 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX1P22670 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RFX1P22670 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX1P22670 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX1P22670 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RFX1P22670 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX1P22670 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX1P22670 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX1P22670 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX1P22670 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX1P22670 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX1P22670 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX1P22670 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms