Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR3P22607 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms