Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK11BP21127 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms