Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL17P18621 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL17P18621 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL17P18621 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL17P18621 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL17P18621 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL17P18621 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL17P18621 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL17P18621 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL17P18621 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL17P18621 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL17P18621 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL17P18621 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL17P18621 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL17P18621 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL17P18621 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL17P18621 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL17P18621 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL17P18621 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL17P18621 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL17P18621 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL17P18621 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL17P18621 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL17P18621 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL17P18621 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL17P18621 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL17P18621 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL17P18621 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL17P18621 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL17P18621 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL17P18621 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL17P18621 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL17P18621 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL17P18621 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL17P18621 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL17P18621 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL17P18621 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL17P18621 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL17P18621 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL17P18621 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL17P18621 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL17P18621 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL17P18621 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL17P18621 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL17P18621 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RPL17P18621 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RPL17P18621 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL17P18621 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL17P18621 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL17P18621 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL17P18621 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL17P18621 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL17P18621 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL17P18621 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL17P18621 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL17P18621 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL17P18621 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL17P18621 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL17P18621 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL17P18621 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL17P18621 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL17P18621 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL17P18621 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL17P18621 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL17P18621 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL17P18621 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL17P18621 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL17P18621 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL17P18621 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL17P18621 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL17P18621 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL17P18621 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL17P18621 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL17P18621 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL17P18621 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL17P18621 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL17P18621 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL17P18621 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL17P18621 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL17P18621 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL17P18621 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL17P18621 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL17P18621 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL17P18621 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL17P18621 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL17P18621 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL17P18621 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL17P18621 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL17P18621 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL17P18621 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL17P18621 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL17P18621 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL17P18621 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL17P18621 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL17P18621 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL17P18621 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL17P18621 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL17P18621 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL17P18621 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL17P18621 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms