Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTPS1P17812 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms