Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRF1P14222 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRF1P14222 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRF1P14222 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRF1P14222 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRF1P14222 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRF1P14222 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRF1P14222 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRF1P14222 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRF1P14222 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRF1P14222 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRF1P14222 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRF1P14222 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRF1P14222 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRF1P14222 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRF1P14222 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRF1P14222 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRF1P14222 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PRF1P14222 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRF1P14222 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRF1P14222 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRF1P14222 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRF1P14222 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRF1P14222 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRF1P14222 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRF1P14222 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRF1P14222 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRF1P14222 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRF1P14222 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRF1P14222 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRF1P14222 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRF1P14222 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRF1P14222 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRF1P14222 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRF1P14222 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRF1P14222 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRF1P14222 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRF1P14222 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRF1P14222 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRF1P14222 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRF1P14222 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRF1P14222 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRF1P14222 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRF1P14222 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRF1P14222 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRF1P14222 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRF1P14222 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRF1P14222 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRF1P14222 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRF1P14222 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRF1P14222 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRF1P14222 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRF1P14222 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRF1P14222 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRF1P14222 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRF1P14222 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRF1P14222 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRF1P14222 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRF1P14222 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRF1P14222 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRF1P14222 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRF1P14222 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRF1P14222 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRF1P14222 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRF1P14222 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRF1P14222 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRF1P14222 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRF1P14222 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRF1P14222 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRF1P14222 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRF1P14222 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRF1P14222 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRF1P14222 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRF1P14222 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRF1P14222 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRF1P14222 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRF1P14222 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRF1P14222 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRF1P14222 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRF1P14222 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRF1P14222 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRF1P14222 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRF1P14222 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRF1P14222 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRF1P14222 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRF1P14222 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRF1P14222 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRF1P14222 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRF1P14222 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRF1P14222 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRF1P14222 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRF1P14222 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRF1P14222 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRF1P14222 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRF1P14222 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRF1P14222 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRF1P14222 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRF1P14222 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRF1P14222 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRF1P14222 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms