Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms