Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1P11387 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1P11387 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1P11387 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1P11387 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1P11387 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1P11387 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1P11387 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1P11387 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1P11387 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1P11387 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1P11387 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1P11387 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1P11387 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1P11387 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1P11387 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1P11387 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1P11387 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1P11387 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1P11387 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1P11387 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1P11387 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1P11387 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1P11387 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1P11387 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1P11387 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1P11387 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1P11387 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1P11387 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1P11387 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1P11387 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1P11387 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1P11387 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1P11387 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1P11387 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1P11387 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1P11387 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1P11387 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1P11387 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1P11387 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1P11387 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP1P11387 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP1P11387 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP1P11387 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP1P11387 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP1P11387 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP1P11387 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP1P11387 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP1P11387 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP1P11387 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP1P11387 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP1P11387 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP1P11387 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP1P11387 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP1P11387 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP1P11387 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP1P11387 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP1P11387 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP1P11387 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP1P11387 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP1P11387 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP1P11387 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP1P11387 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP1P11387 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP1P11387 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP1P11387 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP1P11387 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP1P11387 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP1P11387 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP1P11387 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP1P11387 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP1P11387 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP1P11387 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
TOP1P11387 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP1P11387 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP1P11387 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP1P11387 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP1P11387 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP1P11387 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP1P11387 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP1P11387 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP1P11387 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP1P11387 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP1P11387 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP1P11387 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP1P11387 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP1P11387 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP1P11387 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP1P11387 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP1P11387 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP1P11387 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP1P11387 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP1P11387 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP1P11387 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP1P11387 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP1P11387 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP1P11387 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP1P11387 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP1P11387 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP1P11387 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms