Protein–RNA interactions for Protein: P0DKB5

TPBGL, Trophoblast glycoprotein-like, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGLP0DKB5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPBGLP0DKB5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms