Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms