Protein–RNA interactions for Protein: P09564

CD7, T-cell antigen CD7, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD7P09564 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD7P09564 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD7P09564 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD7P09564 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD7P09564 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD7P09564 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD7P09564 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD7P09564 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD7P09564 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD7P09564 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD7P09564 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD7P09564 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD7P09564 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD7P09564 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD7P09564 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD7P09564 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD7P09564 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD7P09564 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD7P09564 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD7P09564 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD7P09564 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD7P09564 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD7P09564 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD7P09564 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD7P09564 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD7P09564 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD7P09564 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD7P09564 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD7P09564 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD7P09564 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD7P09564 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD7P09564 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD7P09564 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD7P09564 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD7P09564 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD7P09564 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD7P09564 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD7P09564 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD7P09564 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD7P09564 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD7P09564 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD7P09564 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD7P09564 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD7P09564 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD7P09564 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD7P09564 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD7P09564 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD7P09564 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD7P09564 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD7P09564 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD7P09564 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD7P09564 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD7P09564 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD7P09564 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD7P09564 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD7P09564 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD7P09564 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD7P09564 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD7P09564 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD7P09564 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD7P09564 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD7P09564 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD7P09564 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD7P09564 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD7P09564 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD7P09564 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms