Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSF1RP07333 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms