Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDN1P05305 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDN1P05305 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDN1P05305 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDN1P05305 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDN1P05305 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDN1P05305 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDN1P05305 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDN1P05305 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDN1P05305 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDN1P05305 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDN1P05305 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDN1P05305 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDN1P05305 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDN1P05305 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDN1P05305 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EDN1P05305 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDN1P05305 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDN1P05305 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EDN1P05305 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EDN1P05305 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDN1P05305 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EDN1P05305 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDN1P05305 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDN1P05305 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDN1P05305 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDN1P05305 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDN1P05305 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDN1P05305 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDN1P05305 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDN1P05305 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDN1P05305 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDN1P05305 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDN1P05305 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDN1P05305 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDN1P05305 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDN1P05305 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDN1P05305 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDN1P05305 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDN1P05305 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDN1P05305 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDN1P05305 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDN1P05305 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDN1P05305 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDN1P05305 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDN1P05305 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDN1P05305 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EDN1P05305 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EDN1P05305 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDN1P05305 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EDN1P05305 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDN1P05305 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDN1P05305 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDN1P05305 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDN1P05305 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDN1P05305 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDN1P05305 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDN1P05305 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDN1P05305 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDN1P05305 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDN1P05305 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDN1P05305 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDN1P05305 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDN1P05305 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDN1P05305 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EDN1P05305 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDN1P05305 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDN1P05305 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDN1P05305 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EDN1P05305 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EDN1P05305 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EDN1P05305 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EDN1P05305 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDN1P05305 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDN1P05305 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDN1P05305 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDN1P05305 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDN1P05305 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDN1P05305 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDN1P05305 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDN1P05305 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDN1P05305 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDN1P05305 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDN1P05305 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDN1P05305 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDN1P05305 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDN1P05305 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDN1P05305 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDN1P05305 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDN1P05305 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDN1P05305 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDN1P05305 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDN1P05305 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDN1P05305 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDN1P05305 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDN1P05305 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDN1P05305 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDN1P05305 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDN1P05305 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDN1P05305 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms