Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PCCAP05165 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCCAP05165 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCCAP05165 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCCAP05165 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCCAP05165 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCCAP05165 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCCAP05165 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCCAP05165 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCCAP05165 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCCAP05165 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCCAP05165 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCCAP05165 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCCAP05165 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCCAP05165 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCCAP05165 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCCAP05165 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCCAP05165 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCCAP05165 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCCAP05165 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCCAP05165 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCCAP05165 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCCAP05165 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCCAP05165 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCCAP05165 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PCCAP05165 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCCAP05165 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCCAP05165 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCCAP05165 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCCAP05165 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCCAP05165 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCCAP05165 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCCAP05165 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCCAP05165 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCCAP05165 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCCAP05165 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCCAP05165 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCCAP05165 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCCAP05165 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCCAP05165 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCCAP05165 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCCAP05165 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCCAP05165 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PCCAP05165 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCCAP05165 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCCAP05165 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCCAP05165 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCCAP05165 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCCAP05165 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCCAP05165 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCCAP05165 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCCAP05165 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCCAP05165 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCCAP05165 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCCAP05165 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCCAP05165 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCCAP05165 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCCAP05165 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCCAP05165 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCCAP05165 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCCAP05165 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PCCAP05165 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCCAP05165 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCCAP05165 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCCAP05165 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCCAP05165 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCCAP05165 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PCCAP05165 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCCAP05165 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PCCAP05165 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCCAP05165 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCCAP05165 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCCAP05165 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PCCAP05165 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCCAP05165 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCCAP05165 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCCAP05165 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCCAP05165 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCCAP05165 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCCAP05165 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCCAP05165 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCCAP05165 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PCCAP05165 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCCAP05165 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCCAP05165 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCCAP05165 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCCAP05165 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCCAP05165 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCCAP05165 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCCAP05165 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCCAP05165 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCCAP05165 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCCAP05165 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCCAP05165 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCCAP05165 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCCAP05165 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCCAP05165 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCCAP05165 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PCCAP05165 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCCAP05165 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms