Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX6O95503 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX6O95503 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX6O95503 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX6O95503 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX6O95503 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX6O95503 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX6O95503 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX6O95503 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX6O95503 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX6O95503 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX6O95503 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX6O95503 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX6O95503 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX6O95503 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX6O95503 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX6O95503 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX6O95503 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX6O95503 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX6O95503 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX6O95503 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX6O95503 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX6O95503 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX6O95503 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX6O95503 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX6O95503 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX6O95503 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX6O95503 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX6O95503 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX6O95503 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX6O95503 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX6O95503 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX6O95503 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX6O95503 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX6O95503 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX6O95503 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX6O95503 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX6O95503 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX6O95503 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX6O95503 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX6O95503 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX6O95503 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX6O95503 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX6O95503 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX6O95503 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX6O95503 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX6O95503 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX6O95503 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX6O95503 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX6O95503 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX6O95503 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX6O95503 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX6O95503 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX6O95503 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX6O95503 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX6O95503 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX6O95503 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX6O95503 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX6O95503 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX6O95503 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX6O95503 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX6O95503 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX6O95503 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX6O95503 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX6O95503 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX6O95503 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX6O95503 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX6O95503 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX6O95503 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX6O95503 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX6O95503 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX6O95503 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX6O95503 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX6O95503 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX6O95503 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX6O95503 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX6O95503 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX6O95503 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX6O95503 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX6O95503 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX6O95503 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX6O95503 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX6O95503 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX6O95503 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX6O95503 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX6O95503 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX6O95503 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX6O95503 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX6O95503 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX6O95503 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX6O95503 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX6O95503 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX6O95503 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX6O95503 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX6O95503 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX6O95503 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX6O95503 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX6O95503 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX6O95503 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX6O95503 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms