Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPO95166 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms